יש לבחור את קצב הזרימה של משאבת הביוב בהתבסס על קצב הזרימה ההיפותטי לשנייה של ביוב ביתי. כאשר יש התאמת נפח ניקוז, ניתן לבחור בה על סמך קצב הזרימה השעתי המקסימלי של ביוב ביתי. קצב הזרימה של משאבת הניקוז בבור מעלית האש לא צריך להיות פחות מ-10L/s. יש לחשב את ראש משאבת הביוב על סמך גובה ההרמה ואיבודי הצנרת בתוספת ראש בטיחות מסוים. ראש הבטיחות צריך להיות רצוי 0.02~0.03MPa, ומהירות הזרימה בצינור היניקה וצינור הפריקה לא תהיה פחות מ-0.7m/s ולא תעלה על 2.0m/s. יש לבחור את קצב הזרימה של משאבת הביוב בהתבסס על קצב הזרימה ההיפותטי לשנייה של ביוב ביתי. במבנים ציבוריים יש להתקין משאבת המתנה אחת לכל בור ביוב ביתי, ורצוי להפעיל אותה לסירוגין בזמנים רגילים. עבור ניקוז מחדרים נסתרים, מחדרי ציוד ושטיפת רצפות במוסך, אם יש שתי משאבות ביוב או יותר, אין צורך במשאבת המתנה. כאשר לא ניתן להתקין צינור ניקוז במיכל האיסוף, משאבת הביוב צריכה להיות בעלת אספקת חשמל ללא הפרעה. אם ניתן לכבות את צינור כניסת הניקוז, אין צורך באספקת חשמל ללא הפרעה, אך יש להתקין התקן אזעקה. בעת שאיבת ביוב או שפכים המכילים זיהומים גדולים, אין לשלב את צינורות היציאה של משאבות ביוב טבולות במיכלי איסוף שונים. בעת שאיבת שפכים בודדים ניתן לשלב את צינורות היציאה של משאבות ביוב טבולות במיכלי איסוף שונים בהתאם למצב בפועל. כאשר שתי משאבות ביוב או יותר חולקות צינור יציאה בודד, יש להתקין שסתום ושסתום סימון על צינור היציאה של כל משאבת ביוב. יש להתקין שסתום סימון אם זרימה חוזרת אפשרית כאשר משאבת ביוב יחידה מוציאה שפכים. אסור לשלב מערכות ניקוז בלחץ עם צינורות ניקוז כוח הכבידה בתוך המבנה.
כאשר משאבת ביוב טבולה שואבת שפכים המכילים פסולת גדולה, רצוי שהיא תהיה מצוידת במתקן ריסוק; בעת שאיבת שפכים המכילים כמות גדולה של חומר סיבי, יש להשתמש במשאבת ביוב טבולה- גדולה. כאשר הספק המנוע של משאבת הביוב הטבולה גדול או שווה ל-7.5kW או קוטר צינור היציאה גדול מ-DN100 או שווה ל-DN100, ניתן להשתמש בהתקן צימוד עצמי- קבוע; כאשר הספק מנוע משאבת הביוב הטבולה נמוך מ-7.5 קילוואט או קוטר צינור היציאה קטן מ-DN100, ניתן להשתמש במתקן נייד של צינור גמיש. בעת שימוש במשאבות ביוב טבולות לניקוז מיכלי איסוף שפכים, יש להתקין התקן חיבור עצמי- קבוע כדי להקל על תחזוקת המשאבה. משאבות ביוב טבולות צריכות להיות מסוגלות להתנע/עצירה אוטומטית והתנעה/עצירה ידנית בזירת האירוע. ניתן להפעיל מספר משאבות ביוב טבולות במקביל ולסירוגין, או להפעילן במקטעים.
משאבות ניקוז המשמשות בבניינים כוללות משאבות ביוב טבולות, משאבות ביוב נוזלי טבולות, משאבות ביוב אנכיות ומשאבות ביוב-מתפרקות. מכיוון שחללים בודדים בתוך מבנים קטנים יחסית ונפחי הניקוז אינם גדולים, עדיפות לניקוז משאבות ביוב טבולות ומשאבות ביוב טבולות. משאבות ביוב טבולות משמשות בדרך כלל במקומות חשובים. משאבות ביוב אנכיות ומשאבות ביוב-מתפרצות עצמיות דורשות רטט-יסודות מבודדים, כניסת מים-לעצמית, ותופסות כמות מסוימת של מקום, כך שכמעט ולא נעשה בהן שימוש בבניינים.
