ניתן להשתמש במשאבות ביוב הן להזרמה והן לשאיבת מים. בעת ההזרמה, משאבת הביוב מעבירה מים ממקום נמוך יותר למקום גבוה יותר או רחוק יותר, ובכך מזרימה שפכים. בעת השאיבה, משאבת הביוב שואבת מי תהום או מי באר ובכך מספקת מים נקיים. בשימוש מעשי, משאבות ביוב יכולות לבצע הן פעולות פריקה והן פעולות שאיבה לפי הצורך, מה שהופך אותן לסוג מעשי מאוד של ציוד משאבה.
